一般情況下，供精寶寶是不會出現患罕見病這種情況的，因為供精使用的都是精子庫內的精源，而精子庫會提前對捐精者身體健康情況、精液質量、有無遺傳疾病等進行全面檢查，只有各方面過關符合要求后才能捐獻精子。不過，供精生的孩子會面對區別對待的問題，因為和父親沒有血緣關系，所以孩子可能會存在自卑情況，與家人越來越疏遠。

供精生的孩子可能會面臨的問題主要集中在家庭上，雖然在精子庫申請精子生育后代后，孩子不認爹的這種概率不高，但也不排除有可能，出現這種情況極有可能對家庭會產生一定影響。

此外，通過供精生育這件情，不僅要瞞著孩子，也一定要瞞著家里的老人，若是讓家里的老人知道了，可能會有所埋怨，造成家庭矛盾，家里人無法擺正心態，就會導致家庭分裂。

通過供精助孕生下孩子后，男性也應該理性的對待寶寶，不要太糾結孩子和自己沒有血緣關系這件事，想的太多，對婚姻和孩子最終會造成傷害。

供精生的孩子得罕見病的幾率不大，在大多數情況下，醫院提供的精子來源是高質量的精子，都是經過較為嚴格的篩選過后才會使用給需要做供精的家庭，所以試管受精通常沒有得罕見病的風險。

不過，如果女性有遺傳問題、染色體異常，或在后期的妊娠當中，女性不規律作息或者是不忌口、經常在不良環境下生活的話，就有可能會導致胎兒出現缺陷的可能。