做第三代試管嬰兒前需要夫妻雙方全面的檢查的，女方性激素6項、卵泡的檢查、男方精子精液方面的檢查等，之后再進入周期開始試管助孕，前期流程與一代、二代試管是一致的，后期會增加一步胚胎篩查。大致流程步驟可分為5步，首先完善雙方的檢查、制定方案、胚胎培養、胚胎基因篩查，最后是移植。

第三代試管嬰兒的主要過程是先把精子和卵子取出來結合形成受精卵，受精卵培養形成胚胎，之后把胚胎里的細胞提取出來檢測基因和染色體，觀察是否有遺傳性疾病，沒問題的情況下在把胚胎放入子宮里面去。這也是目前最適合做試管嬰兒有遺傳性疾病人群的方式。

染色體異常，做第三代試管嬰兒是很合適的選擇，第三代試管嬰兒技術并不是比第一代和第二代先進，只是針對的群體不同，第三代試管嬰兒技術是可以針對有明確的基因遺傳病患者，減少新生兒攜帶致病基因的幾率。

第三代試管嬰兒的大部分步驟和常規試管嬰兒較為類似，整體可以分為5個步驟，具體操作內容如下：

1.做第三代試管嬰兒是需要滿足一定條件的，所以在前期夫妻雙方是需要進行全面檢查的，檢查之后按醫囑定制方案調理身體；
2.確定可以做第三代試管后，會依照定制的方案進行促排卵，一般10多天左右，同時男方需要進行取精，與卵子結合形成受精卵；
3.得到胚胎后需要進行體外培養，到第5-6天時，取細胞進行檢測確定是否攜帶致病基因；
4.醫生會根據健康囊胚的發育能力和孕媽狀態選擇移植的胚胎；
5.在做完試管嬰兒后的14天后要抽血檢查是否受孕成功。
做第三代試管嬰兒，整體耗費的時間大概在2-3個月，費用需要5-8萬元左右，因個人的體質不同，費用會有一定的差異。

第三代試管嬰兒就只比平常試管嬰兒多了兩個步驟，第一個是胚胎活檢，用于從胚胎上取下細胞用于檢測，需要特殊的激光打孔儀、特殊培養皿以及特定的試劑；第二個是對取下的細胞進行診斷，目前常用的是熒光原位雜交和基因芯片技術，兩種技術都需要用進口試劑及耗材，因此第三代試管嬰兒價格會更加昂貴。
做第三代試管嬰兒，孕婦年齡和獲得胚胎數量的多少是影響成功率的關鍵因素，第三代試管嬰兒的對象往往是遺傳病、反復自然流產、平衡易位等患者，通常年齡偏大，獲得胚胎數量較少，通過篩選后健康的胚胎更少，因此第三代試管成功率是不如平常試管的，但一旦妊娠，其流產率是非常低的