1.身體損傷

在進行試管嬰兒手術時，需要進行輔助生殖技術操作，如取卵、受精、胚胎移植等。這些操作都需要通過陰道進入子宮內部，對女性的生殖系統造成了一定程度上的創傷和損傷。手術過程中可能會發生出血、感染等并發癥，嚴重時甚至可能導致子宮穿孔等嚴重后果。

在取卵過程中使用的促排卵藥物也會對女性產生一定的副作用，如卵巢過度刺激綜合征（OHSS），表現為腹脹、惡心、嘔吐等癥狀。這些身體損傷和副作用可能會使女性對試管嬰兒產生后悔情緒。

2.后遺癥

試管嬰兒手術不僅可能在操作過程中對女性身體造成損傷，還有可能留下一些后遺癥。例如子宮內膜異位是一種常見的并發癥，導致月經不調、盆腔疼痛等問題。此外有報道稱試管嬰兒手術可能增加子宮肌瘤的風險。

另外一個重要的后遺癥是早產和低出生體重。由于試管嬰兒技術通常會導致多胞胎懷孕，而多胞胎懷孕則會增加早產和低出生體重的風險。這對母親和孩子都是一個巨大的負擔，容易給他們帶來健康問題。

3.心理壓力

進行試管嬰兒治療本身就是一個漫長而痛苦的過程，女性需要經歷一系列的檢查、手術和藥物治療。這些過程不僅對身體造成負擔，也對心理狀態產生影響。女性可能會感到焦慮、緊張和沮喪，特別是在多次失敗后。

試管嬰兒手術的成功率并不高，很多夫婦需要多次嘗試才能成功懷孕。這種反復嘗試的過程會給女性帶來極大的心理壓力和痛苦，有時甚至導致抑郁癥等精神問題。

4.經濟負擔

試管嬰兒治療通常需要較長時間和大量資金支持。從最初的檢查、手術費用到后續的藥物費用和隨訪治療費用，都需要夫婦承擔相當大的經濟壓力。

在一些國家或地區，并沒有社會保險覆蓋試管嬰兒治療費用，使得更多的夫婦無法負擔這樣昂貴的醫療費用。因此在考慮進行試管嬰兒治療時，夫婦需要慎重考慮自己的經濟實力和承受能力，以免為之后的生活造成過大的負擔。

5.倫理道德問題

試管嬰兒技術在一定程度上違背了自然法則，引發了一些倫理和道德方面的爭議。有人認為試管嬰兒技術可能導致遺傳疾病的傳播，對人類基因庫產生不良影響。此外多胞胎懷孕也會增加孩子出現先天性異常的風險。

另外一個倫理和道德問題是選擇性別。有些夫婦希望通過試管嬰兒技術選擇孩子的性別，這引發了對于性別平等和社會公正的討論。